El Alto Mando quedó conformado de la manera siguiente: comandante en jefe de las Fuerzas Armadas, general de Ejército Hugo Eduardo Arandia López; jefe accidental del Estado Mayor General del Comando en Jefe de las Fuerzas Armada, contraalmirante Gonzalo Víctor Vigabriel Sánchez; comandante general accidental del Ejército, general de brigada Juan José Zúñiga Macías; comandante general accidental de la Fuerza Aérea, general de Brigada Aérea Marcelo Javier Zegarra Gutiérrez, y comandante general accidental de la Armada, contraalmirante Juan Arnés Salvador.